En 1948 apareció el primer volumen de la publicación, Anales de Historia Antigua y Medieval, como órgano del Instituto.
Su objetivo fue promover la investigación a través de la interpretación de fuentes y el replanteo de problemas historiográficos. Publicaron desde entonces investigadores nacionales y extranjeros, como Sánchez Albornoz, Heers, Fernández Galiano, de Ferdinandy, Imbelloni, Benito Ruano, Altheim, Kerenyi, Lozinski, Carlé, Guglielmi, Orduna, Bauza, etc. Durante largos años la revista contó con una dirección editorial formada por investigadores del propio Instituto.
En 1991, se renueva el Consejo Directivo de la revista, se acuerda en un proyecto científico, y se establecen modificaciones de procedimiento, cambios que se tradujeron en el actual perfil de Anales...
La investigación fue definida en el campo de la historia social, recogiendo una tradición que se remonta a José Luis Romero. Más allá de la indefinida amplitud del término "social", esta palabra evoca, para los miembros de la dirección editorial, una singular escuela historiográfica académica argentina. Impulsada por este historiador, su distintivo estuvo antes en la diferenciación de la producción factográfica e institucionalista, que en una homogeneidad teórico metodológica. La dirección de la revista se propuso, desde entonces, rescatar uno de los aspectos más perdurables del magisterio de Romero: la coexistencia en un mismo medio de distintos enfoques no tradicionales.
En correspondencia con esta línea se cuestionó una divisoria tripartita de la historia europea, derivada de la periodización del humanismo, que actuales tendencias de estudio concentradas en el movimiento profundo de estructuras seculares han tornado en muchos casos obsoleta. Se implementó también un cambio en la política de selección de trabajos, sometiendo todos los estudios monográficos al arbitraje de un Comité Editorial Externo formado por investigadores de reconocido mérito científico que con su colaboración han contribuido a que nuestra revista se inscriba en la categoría de publicación internacional.
El marco temporal de trabajo del Instituto se amplió a lo que la taxonomía escolar todavía vigente llama Época Moderna, y la revista desde 1997 (volumen 31) cambió su nombre por Anales de Historia Antigua, Medieval y Moderna, incorporando estudios que comprenden el conjunto de problemáticas de la era pre burguesa de la historia europea.
Son miembros del Comité Externo de la revista, con funciones de evaluación: Chris Wickham, Bernard Vincent, Roger Chartier, Ángel Vaca, Joseph Salrach, Domingo Plácido, Guido Clemente, Maurice Aymard, Giovanni Cherubini, Adriano Prósperi, José María Monsalvo, Felipe Maíllo Salgado, Francisco Lomas, Cristina La Rocca, Benjamín Kedar, John Haldon, Stefano Gasparri, Pablo Díaz Martínez, María Victoria Escribano Paño, Germán Navarro Espinach, Sauro Gelichi, Giovanni Grado Merlo, Marina Benedetti, Carlos Petit, Felipe Maillo Salgado, Antoni Furió, José Fortea Pérez, Juana Torres Prieto, Jacques Dalarum, Javier Arce y Antonio Bonachía, entre otros.
Se afirmó así el carácter pluralista de Anales de Historia Antigua, Medieval y Moderna, revista que se abrió a todas las expresiones de la historia social, constituyendo el exclusivo requisito de publicación, un apropiado nivel de calidad.
La revista apareció de manera regular a lo largo de todos esos años. Se mantiene canje permanente con publicaciones de prestigiosas de Universidades europeas y americanas que han permitido actualizar nuestra hemeroteca, a la vez que un acercamiento entre especialistas.
A partir de 1996 se ha incorporado en algunos números un dossier temático. Se inició la serie con el número 28 dedicado a José Luis Romero con el fin de tratar cuestiones historiográficas contando con contribuciones de prestigiosos profesores nacionales y extranjeros.
A partir de 2009 el Instituto inicia el proceso de digitalización de sus volúmenes al considerar que la incorporación de nuevas tecnologías constituye una importante alternativa en las formas de transmisión del conocimiento. El acceso será gratuito desde el sitio de la Facultad de Filosofía y Letras de la Universidad de Buenos Aires.
Prestigiosos investigadores han publicado en la colección: Chris Wichmam (University of Oxford), Adriano Prosperi (Scuola Normale Superiore di Pisa), Ramón Teja (Universidad de Cantabria), Ricardo Olmos Romera (Escuela Española de Historia y Arqueología en Roma, CSIC), Domingo Plácido (Universidad Complutense de Madrid), Carlo Ginzburg (Scuola Normale Superiore di Pisa), Josep Salrach (Universitat Pompeu Fabra), Horacio Botalla (Universidad de Buenos Aires, UNTREF), Giovanni Grado Merlo (Università degli Studi di Milano), Pablo Díaz Martínez (Universidad de Salamanca), Marina Benedetti (Università degli Studi di Milano), Pierre Briant (College de France), Lelia Cracco Ruggini (Università degli Studi di Milano), Sauro Gelichi (Università Ca'Foscari-Venezia), María Cristina La Rocca (Unversità degli Studi di Padova), John Haldon (University of Birmingham), Stefano Gasparri (Università Ca'Foscari-Venezia), José María Monsalvo Antón (Universidad de Salamanca), Arturo Morgado García (Universidad de Cádiz), Silvia Magnavacca (Universidad de Buenos Aires), Francisco Bertelloni (Universidad de Buenos Aires), Gian Pietro Broggiolo (Universitá degli Studi di Padova), Antony Snodgrass (Clare College, Cambridge), Peter Rhodes (Durham University), Roger Chartier (EHESS), Marta Madero (Universidad de Buenos Aires), María Victoria Escribano Paño (Universidad de Zaragoza), Armando Petrucci (Scuola Normale Superiore di Pisa), Jean Claude Schmitt (EHESS), Alain Guerreau (CNRS), Felipe Maillo Salgado (Universidad de Salamanca), Stephen Rigby (University of Manchester), Jacques Annequin (ISTA), Domenico Vera (Università degli Studi di Parma), John Haldon (University of Princeton), Bernard Vincent (EHESS), Arnaldo Marcone (Universitá degli Studi di Udine), Brian Ward Perkins (University of Oxford), Peter Green (University of Iowa), Stephen Rigby (University of Manchester), Giovanni Cherubini (Università degli Studi di Firenze), Bartolome Bennassar (Universidad de Toulouse), Robin Osborne (University of Cambridge), Walter Goffart (Yale University), Guido Clemente (Università degli Studi di Firenze), Carlos Astarita (Universidad de Buenos Aires, Universidad Nacional de La Plata) y Hugo Zurutuza (Universidad de Buenos Aires) entre otros.
Comité Editor Interno
Carlos Astarita - Hugo Zurutuza - Rosana Vasallo - Horacio Botalla -
Carlos García Mac Gaw - Laura da Graca- Corina Luchía - Julián Gallego